蜂蜜儲存時應放在陰涼、乾燥、清潔、通風處，温度保持在5～10℃，空氣濕度不超過75%的環境中，裝蜂蜜的容器要蓋嚴，防止漏氣，減少蜂蜜與空氣接觸。蜂蜜由於濃度極高，滲透壓大，進入其中的細胞會嚴重脱水死亡，所以蜂蜜不易變質，蜂蜜生產廠家一般把蜂蜜保質期定2年或者18個月。
蜂蜜在常温、常壓下，具有兩種不同物理狀態，即液態和結晶態。液態蜜也就是蜂蜜從蜂巢中分離出來並始終保持着透明或半透明黏稠狀的液體。然而多數品種蜂蜜放置一段時間後，尤其在氣温較低時，逐漸形成結晶態，這樣蜂蜜稱為結晶蜜。
蜂蜜是糖的過飽和溶液，低温時會產生結晶，會生成結晶的是葡萄糖，不產生結晶的部分主要是果糖。蜂蜜在釀造、運輸與儲存過程中，可能受到肉毒桿菌的污染。
天然蜜就是蜜蜂採集花蜜釀造而成的。它們來源於植物的花內蜜腺或在外蜜腺，通常我們所説的蜂蜜就是天然蜜，又因來源於不同的蜜源植物，又分為某一植物花期為主體的各種單花蜜。
