免税店免的是關税、增值税和消費税。關税是引進出口商品經過一國關境時，由政府所設置的海關向其引進出口商所徵收的税收。免税店是免了進口增值税和關税，是在進口時候免了關税和增值税，但是不會免銷售時的增值税，消費税是在對貨物普遍徵收增值税的基礎上，對少數消費品再徵收的一個税種。
計算進口增值税計算公式:進口增值税=（關税完税價格+關税）/（1-消費税率）×增值税率。進口關税税款的基本公式是：進口關税税額=完税價格×進口關税税率。
我國現行消費税的徵收範圍主要包括：煙、酒、貴重首飾、高檔化粧品、成品油、小汽車、高檔手錶等等。對於內地而言，化粧品和煙酒的税率是很高的，所以免税店裏的化粧品、煙酒的價格就比外面便宜了很多。
免税商品所免徵的税種包括關税、進口環節的增值税、消費税等，並非免去所有環節的所有税種的税。説它免税，僅僅針對進口環節而言，當其進入銷售環節時，還應照章徵税。因此，免税商店零售免税貨物時應繳納增值税。
