車主自行去税務局申請車船税退税的具體流程：
納税人向所在地的區地方税務局(税務所)申請車船税退税，需提供以下資料：
1、《車船使用税退税申請表》或《誤繳、溢繳退税申請表》及《車船使用税退税申請表(附表)》，均可在地税局税務所領取；
2、車船管理部門開具的與退税事由相對應的有關證明原件；
3、税務登記證、個人有效身份證件複印件；
4、辦理退税車船的機動車行駛證或機動車登記證書；
5、車船税完税憑證明或保單和“保險業專用發票”；
6、支付退税的銀行賬號證明(個人為申請人銀行存摺、單位為銀行印鑑卡)；
7、被盜退税的，還需提交派出所出具的被盜立案證明及車管所開具的“停駛通知書”；
8、報廢退税的，還需提交車管所出具的“註銷通知書”；
9、税務機關要求提供的其他資料。
網上辦理
登錄國家税務總局重慶市電子税務局（國家税務總局重慶市税務局()），選擇“我要辦税”，進入“一般退（抵）税管理”，再選擇“車船税退抵税”，辦理車船税退税事項。税務機關辦理完成後，納税人即可獲取結果信息，並查詢和打印受理結果。
