杭州南站在杭州市蕭山區站前路1號。新杭州南站站房規劃的結構為五層，分別為地下二層（地鐵站廳層）、地下一層（出站換乘層）、廣場層、候車層和商業候車室夾層。杭州地鐵5號線位於主城區的站點已經開建了，規劃中的杭州地鐵5號線一期工程起於餘杭區金星站，從主城區過江後，終於蕭山區姑娘橋站，可直達火車南站。
杭州南站將建設成為集鐵路、地鐵5號線、11號線（規劃中）和城市公共汽車交通、出租車及社會車輛等多樣化的交通方式為一體的現代化綜合性客運交通樞紐。截至2013年7月，杭州南站站場為3台7線。改造後杭州南站預計於2018年底前啟用，新杭州南站將變為7台21線。杭州南站的途經線路有滬昆鐵路、杭甬鐵路、杭甬高速鐵路、滬昆高速鐵路和杭黃高速鐵路。
杭州南站站房建築面積為3642平方米，站前廣場27972平方米，站場為7台21線。是中國鐵路上海局集團有限公司管轄的一座鐵路車站，是杭州錢塘江南岸唯一一座客運火車站，也是杭州鐵路樞紐的主要客站之一。
