區別：應付賬款是企業在正常經營過程中，因購買材料、商品和接收勞務供應等而應付給供應單位的款項；預付賬款是企業按照合同或有關協議規定而預選支付給供貨單位或勞務提供者的定金或貨款。聯繫：他們都是往來賬科目，還有就是貨到後預付賬款轉應付賬款，這是它們之間的聯繫。
應付賬款
是企業應支付但尚未支付的手續費和佣金。是會計科目的一種，用以核算企業因購買材料，商品和接受勞務供應等經營活動應支付的款項。通常是指因購買材料，商品或接受勞務供應等而發生的債務。
預付賬款
是指企業按照購貨合同的規定，預先以貨幣資金或貨幣等價物支付供應單位的款項。在日常核算中，預付賬款按實際付出的金額入賬，如預付的材料，商品採購貨款，必須預先發放的在以後收回的農副產品預購定金等。
對購貨企業來説，預付賬款是一項流動資產。預付賬款一般包括預付的貨款預付的購貨定金。施工企業的預付賬款主要包括預付工程款，預付備料款等。
